Modeling of intercellular Ca2+ waves

Thesis Proposal Details

Supervisor: Morten Gram Pedersen

Co-supervisor: Morten Gram Pedersen

Co-supervisor Department/Company: DEI

Creation Date: 08/05/2025 14:35

Description
Onde di calcio tra cellule controllano molteplici funzioni fisiologiche, come per esempio, il battito cardiaco, la guarigione delle ferite, e la secrezione di insulina.
Il progetto riguarda la modellizzazione matematica di onde di calcio osservate in esperimenti in cellule HEK in cui si ha sovraespressa la proteina Cx32 per modificare il gap junction coupling tra le cellule.
L'onda calcio viene stimolata a partire dalla fotolisi di IP3 in una singola cellula e si propaga con diverse velocità e intensità a seconda delle varie condizioni sperimentali. Inoltre, sono stati applicati vari bloccanti di connessine, pannessine e recettori purinergici, tutti coinvolti nella communicazione intercellulare, per caratterizzare il sistema con e senza Cx32 sovraespressa.
Il modello matematico da sviuppare servirebbe per interpretare i risultati. Il modello potrebbe basarsi modelli esistenti della dinamica di Ca2+ intracellulare per poi aggiungere meccanismi realistici della communicazione tra cellule. Il modello sarebbe formato da un sistema di ODE nonlineari da implementare in XPPAUT, MATLAB, o altro linguaggio opportuno. Eventualmente ci sarebbe anche da fare un'analisi matematica del modello.
Dataset and methods

Dataset type: Already acquired data

Dataset description: Caratterizzazione di onde calcio

List of Methods: Modelli matematici, ODEs, sistemi dinamici

Preparatory Courses

Mathematical Cell Biology ; Modeling Methodology for Physiology and Medicine

Tags
Calcio Modello matematico biologia cellulare equazioni differenziali Pedersen
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